MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 44842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021883	GTG	2	6	33372	33377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467424
502	NC_021883	TGGT	2	8	33389	33396	0 %	50 %	50 %	0 %	526467424
503	NC_021883	TAT	2	6	33400	33405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467424
504	NC_021883	TGT	2	6	33445	33450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467424
505	NC_021883	GTT	2	6	33451	33456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467424
506	NC_021883	ATT	2	6	33478	33483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467424
507	NC_021883	ATA	2	6	33489	33494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467424
508	NC_021883	CAC	2	6	33521	33526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467424
509	NC_021883	TAATTT	2	12	33527	33538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467424
510	NC_021883	CAG	2	6	33565	33570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467425
511	NC_021883	AT	3	6	33572	33577	50 %	50 %	0 %	0 %	526467425
512	NC_021883	T	6	6	33593	33598	0 %	100 %	0 %	0 %	526467425
513	NC_021883	TTC	2	6	33642	33647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467425
514	NC_021883	T	7	7	33667	33673	0 %	100 %	0 %	0 %	526467425
515	NC_021883	A	6	6	33695	33700	100 %	0 %	0 %	0 %	526467425
516	NC_021883	CAA	2	6	33703	33708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467425
517	NC_021883	TTG	2	6	33736	33741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467425
518	NC_021883	TAT	2	6	33842	33847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467425
519	NC_021883	ATTTT	2	10	33981	33990	20 %	80 %	0 %	0 %	526467425
520	NC_021883	CATT	2	8	34060	34067	25 %	50 %	0 %	25 %	526467425
521	NC_021883	TTA	2	6	34261	34266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467425
522	NC_021883	ATG	2	6	34287	34292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467425
523	NC_021883	CAA	2	6	34477	34482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467426
524	NC_021883	TTA	2	6	34500	34505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467426
525	NC_021883	GCT	2	6	34512	34517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467426
526	NC_021883	TTG	2	6	34822	34827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467427
527	NC_021883	AGA	2	6	34871	34876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467427
528	NC_021883	AACAAG	2	12	34924	34935	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526467427
529	NC_021883	AGA	2	6	34979	34984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467427
530	NC_021883	CAA	2	6	35008	35013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467427
531	NC_021883	CGT	2	6	35016	35021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467427
532	NC_021883	TAT	2	6	35072	35077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467427
533	NC_021883	AAG	2	6	35122	35127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467427
534	NC_021883	A	6	6	35170	35175	100 %	0 %	0 %	0 %	526467427
535	NC_021883	AAC	2	6	35205	35210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467427
536	NC_021883	ATT	2	6	35214	35219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467427
537	NC_021883	GCA	2	6	35340	35345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467428
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539	NC_021883	TCA	2	6	35404	35409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467428
540	NC_021883	GTT	2	6	35587	35592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467428
541	NC_021883	AAG	2	6	35618	35623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467428
542	NC_021883	TCA	2	6	35677	35682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467428
543	NC_021883	ATAG	2	8	35683	35690	50 %	25 %	25 %	0 %	526467428
544	NC_021883	ATG	3	9	35720	35728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467428
545	NC_021883	TGAT	2	8	35732	35739	25 %	50 %	25 %	0 %	526467428
546	NC_021883	GTA	2	6	35741	35746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467428
547	NC_021883	A	6	6	35798	35803	100 %	0 %	0 %	0 %	526467429
548	NC_021883	A	6	6	35839	35844	100 %	0 %	0 %	0 %	526467429
549	NC_021883	GTGA	2	8	35866	35873	25 %	25 %	50 %	0 %	526467429
550	NC_021883	TTA	2	6	36109	36114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467429
551	NC_021883	ATC	2	6	36349	36354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467429
552	NC_021883	GTG	2	6	36424	36429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467429
553	NC_021883	AGA	2	6	36438	36443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467429
554	NC_021883	CTG	2	6	36494	36499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467429
555	NC_021883	GTG	2	6	36557	36562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467429
556	NC_021883	GAT	2	6	36583	36588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467429
557	NC_021883	AAGC	2	8	36595	36602	50 %	0 %	25 %	25 %	526467429
558	NC_021883	TTA	2	6	36628	36633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467429
559	NC_021883	TCTA	2	8	36674	36681	25 %	50 %	0 %	25 %	526467429
560	NC_021883	TTA	2	6	36691	36696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467429
561	NC_021883	GCGT	2	8	36699	36706	0 %	25 %	50 %	25 %	526467429
562	NC_021883	ATC	2	6	36787	36792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467429
563	NC_021883	GGT	2	6	36934	36939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467429
564	NC_021883	AAACT	2	10	36947	36956	60 %	20 %	0 %	20 %	526467429
565	NC_021883	AAG	2	6	36961	36966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467429
566	NC_021883	GGT	2	6	36973	36978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467429
567	NC_021883	TGA	2	6	37041	37046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467429
568	NC_021883	TTG	2	6	37090	37095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467429
569	NC_021883	AAACAA	2	12	37096	37107	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	526467429
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571	NC_021883	GAT	2	6	37171	37176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467429
572	NC_021883	TTA	2	6	37213	37218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467429
573	NC_021883	ATA	2	6	37365	37370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467430
574	NC_021883	A	6	6	37422	37427	100 %	0 %	0 %	0 %	526467430
575	NC_021883	GGC	2	6	37486	37491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467430
576	NC_021883	A	7	7	37588	37594	100 %	0 %	0 %	0 %	526467430
577	NC_021883	TAG	2	6	37605	37610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467430
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580	NC_021883	GAAA	2	8	37678	37685	75 %	0 %	25 %	0 %	526467430
581	NC_021883	TGG	2	6	37719	37724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467430
582	NC_021883	T	6	6	37742	37747	0 %	100 %	0 %	0 %	526467430
583	NC_021883	ATGGT	2	10	37830	37839	20 %	40 %	40 %	0 %	526467430
584	NC_021883	TGA	2	6	37864	37869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467430
585	NC_021883	TA	3	6	37881	37886	50 %	50 %	0 %	0 %	526467430
586	NC_021883	ACA	2	6	37924	37929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467430
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588	NC_021883	GCT	2	6	38093	38098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467430
589	NC_021883	TGG	2	6	38103	38108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467430
590	NC_021883	AGC	2	6	38116	38121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467430
591	NC_021883	CAAG	2	8	38180	38187	50 %	0 %	25 %	25 %	526467430
592	NC_021883	GAAT	2	8	38194	38201	50 %	25 %	25 %	0 %	526467430
593	NC_021883	GCA	2	6	38225	38230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467430
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596	NC_021883	CAA	3	9	38377	38385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467431
597	NC_021883	TAT	2	6	38508	38513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467431
598	NC_021883	TGA	2	6	38535	38540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467431
599	NC_021883	GAA	3	9	38557	38565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467431
600	NC_021883	GCA	2	6	38584	38589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467431
601	NC_021883	GAA	2	6	38599	38604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467431
602	NC_021883	GGT	2	6	38674	38679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467431
603	NC_021883	GGT	2	6	38695	38700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467431
604	NC_021883	ATG	2	6	38725	38730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467431
605	NC_021883	GAAC	2	8	38877	38884	50 %	0 %	25 %	25 %	526467431
606	NC_021883	TGA	2	6	38943	38948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467431
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611	NC_021883	GGT	2	6	39204	39209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467431
612	NC_021883	CGG	2	6	39245	39250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467431
613	NC_021883	TGGT	2	8	39293	39300	0 %	50 %	50 %	0 %	526467431
614	NC_021883	GTG	2	6	39323	39328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467431
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618	NC_021883	AGTG	2	8	39684	39691	25 %	25 %	50 %	0 %	526467432
619	NC_021883	GCGT	2	8	39725	39732	0 %	25 %	50 %	25 %	526467432
620	NC_021883	TTA	2	6	39781	39786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467432
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622	NC_021883	GGT	2	6	39856	39861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467432
623	NC_021883	ACCG	2	8	39876	39883	25 %	0 %	25 %	50 %	526467432
624	NC_021883	GTG	2	6	39914	39919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467432
625	NC_021883	AGA	2	6	39963	39968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467432
626	NC_021883	GA	3	6	40014	40019	50 %	0 %	50 %	0 %	526467432
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628	NC_021883	T	6	6	40270	40275	0 %	100 %	0 %	0 %	526467433
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